Dans la nef, des arcades brisées, posées sur des piliers soutiennent. Parmi les oeuvres d’art de grand intérêt, on peut remarquer: Jésus et la Samaritaine (1580) de Virgilio Nucci (1ère chapelle de gauche): La Madone du Secours, d’un inconnu de la fin du XV siècle (5e chapelle de gauche): la Madone de Grâce, fresque attribuée à Ottaviano Nelli (3e chapelle de droite): Le baptême de Saint Augustin (1594), de Felice Damiani (4ième chapelle de droite), Le Jugement dernier, réalisé par Nelli avec sans doute l’aide de Jacopo Salimbeni de San Severino sur les fresques de l’abside et de l’arc de triomphe. Dans l’abside sont illustrées les Histoires de la vie de Saint Augustin, tableaux, qui remontent en 1420 environ, représentent un des principaux témoignages de la peinture gothique tardive eugubine.