Segnata da alterne fasi di fortuna costituite da interventi conservativi e da più consistenti azioni di dispersione prodotte dal tempo, dall’incuria e dalla scarsa attenzione degli uomini, la storia delle vicende degli archivi eugubini ha comunque consentito di preservare alla memoria e alla ricerca storica pressoché intatto il patrimonio documentario locale, in gran parte confluito e attualmente conservato nella sezione di Archivio di Stato di Gubbio, istituita nel 1957 e dipendente dal Ministero per i Beni Culturali e Ambientali. Oggetto di ricerche, anche recenti, appassionate e ponderose, svolte da studiosi non solo locali, tale materiale archivistico dispone, peraltro, di strumenti di corredo inadeguati alla sua piena valorizzazione, in gran parte costituiti dagli "inventari" elaborati nel XIX secolo da cultori di storia patria o da archivisti volenterosi quanto improvvisati.

All’Arduini, al Fumi, al Mazzatinti, al Cenci è comunque doveroso riconoscere il grandissimo merito di aver contribuito sostanzialmente, operando spesso in condizioni di estrema difficoltà, alla salvaguardia delle fonti storiche della città. Il momento più fecondo per la valorizzazione della documentazione eugubina coincide con le tendenze storiografiche della seconda metà del XIX secolo. Mazzatinti ricorda "il Gregorovius, il Wüstenfeld e altri germanici illustri", ma sono anche da ricordare i lavori di Cenci, di Lucarelli e nel secolo successivo, sempre per il Medioevo, di Hagemann, nonché i compendi di storia cittadina, dalle origini all’Unità, di Costantini e di Menichetti. Né sono da dimenticare gli importanti contributi tematici contenuti nella serie degli Atti dei Convegni del Centro di Studi umbri.